Durante varios años, la zona de Chaparri fue muy explotado tanto flora como fauna por los mismos pobladores. La comunidad campesina Santa Catalina, cuyos dominios incluían el territorio de Chaparri decidieron donar una gran parte de su territorio con la finalidad de los trabajos de conservación, de tal forma que en el 2001 el estado peruano, a través del INRENA (en la actualidad considerado como SERNANP), reconoció el lugar como la primera Área de Conservación Privada.

Como en toda reserva natural, el objetivo de ello es recuperar hábitats, ya sea de flora o fauna silvestre, de igual manera en ello animales en peligro de extinción, tal es el caso del Oso de Anteojos, la pava aliblanca y el cóndor andino. Chaparri debido a su gran vegetación también es lugar o centro de investigación científica dedicada a los ecosistemas del bosque seco y animales endémicas.